用Intel®加速LAMMPS

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本文于2018年10月16日发表于知乎专栏,查看原文

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1.安装Intel® MPI Library并激活，如source /share/apps/intel/compilers_and_libraries/linux/bin/compilervars.sh intel64。

2.编译LAMMPS前，make yes-user-intel激活USER-INTEL package。

3.用make intel_cpu_intelmpi编译LAMMPS。

4.用KMP_BLOCKTIME=0 mpirun -np 36 lmp_intel_cpu_intelmpi -pk intel 0 omp 2 -sf intel -in in.script运行LAMMPS。

5.在in.script的开头加入processors * * * grid numa。

参考资料：https://lammps.sandia.gov/doc/Speed_intel.html