Jinzhe Zeng's Blog

苟利国家生死以,岂因祸福避趋之

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本文于2020年10月24日发表于微信公众号,查看原文
本文于2020年10月24日发表于知乎专栏,查看原文

很多人对Anaconda有这样的误解,认为conda只是用来管理Python packages的。实际上,conda更神奇的功能,是可以打包编译后的程序,并且不需要root权限即可安装。一般来说,分发编译后的程序总有各种各样的静态库的依赖问题,所以Anaconda把这些依赖库也做成了conda packages,这样就能确保任何机器都能安装了。libtensorflow_cc是TensorFlow的C++库,之前介绍过如何编译,但编译成conda packages,仍需要费一番功夫。本文介绍2.3版本的构建方法:

我们先来看deepmd-kit-recipes/libtensorflow_cc-feedstockrecipe/build.sh文件。conda-build构建时,会默认把build.sh作为编译脚本。

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if [ ${cuda_compiler_version} == "None" ]; then
bash $RECIPE_DIR/build_cpu.sh
fi
if [ ${cuda_compiler_version} != "None" ]; then
bash $RECIPE_DIR/build_gpu.sh
fi
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本文于2020年8月23日发表于知乎专栏,查看原文
本文于2020年8月24日发表于微信公众号,查看原文

Amber20

假设你已经有了Amber20的源代码,名叫amber20_src,并且现在在这个目录里面。

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本文于2020年8月20日发表于知乎,查看原文
本文于2020年8月22日发表于微信公众号,查看原文

作为一所公立大学,Rutgers University所有教职工的工资通过某种方式实现了公开。在这个页面可以查到去年所有人的工资。

我的课题组

我的课题组中,每个人的工资如下(只列举去年一整年都有工作的,下同):

Title人数2019年收入
Professor1$303,608
Associate Research Professor2$140,258和$140,843
Assistant Research Professor2$63,637和$69,517
Graduate Assistant1$33,189
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本文于2020年8月18日发表于微信公众号,查看原文
本文于2020年8月18日发表于知乎专栏,查看原文

此前,本专栏介绍了conda install的使用方法,以及conda install安装deepmd-kit的方法。但是,目前对conda build构建conda packages的讨论甚少。授之以鱼不如授之以渔,这一系列将以deepmd-kit的packages为例,介绍conda包的构建方法。


本文先介绍python包的构建配方(recipe)。在deepmd-kit-feedstock这一项目中,recipe文件夹下包括conda_build_config.yamlmeta.yaml两个YAML文件,其中conda_build_config.yaml包含了构建变量,而meta.yaml包含了构建的元信息。

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本文于2020年8月12日发表于知乎,查看原文
本文于2020年8月15日发表于微信公众号,查看原文

8月12日下午,在学校要求下,去校医院做了核酸检测,全程自助+无接触。大概步骤是

步骤

刷校园卡领取试剂包。把唾沫吐到管子里,吐至刻度线。(要求没有气泡,但似乎没法避免。)把检测试剂当瓶盖拧上,这时蓝色试剂会自动流下去。摇匀。贴上名字,连同贴上条形码的申请表格一同放入袋中,扔进箱子里。

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本文于2020年7月11日发表于知乎专栏,查看原文
本文于2020年7月12日发表于微信公众号,查看原文

虽然我高中的时候就想着将来要科研,自主招生面试的时候也是这么说的,但直到大二下学期,我还不知道自己将来要往哪个方向走,只知道可能要争取推免资格,为此准备了一大堆加分项目。在对科研的憧憬中,2017年9月,我加入了朱通老师的课题组。加入课题组的第一天,老师问我为什么想做科研,又为什么想做计算化学的科研?我回答了以后,他又告诉我,一定要出国读书,我表示自己的英语很糟糕,他却说,没关系的。当时,我对科研界招聘的要求毫无概念,对国外学校的录取要求更是一无所知。海外经历的重要性,也仅仅从数次组会中得知。大三这一年,我怀着对科学的追求,将全部的精力放在科研上[1]。

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本文于2020年5月30日发表于知乎专栏,查看原文
本文于2020年5月30日发表于微信公众号,查看原文

准备开启一个《我的第X篇论文》系列,目的是自己写得开心,可能含有大量专业词汇。按照只看一作的评价标准,以及发文章的速度,不会频繁更新。


时至2018年3月,那时我刚刚结束了一个失败的课题,对molecular dynamics (MD)有了初步了解。大三下学期是一个“无课学期”,我的课表上只有4学分的课,有大量富余时间。开学后,导师告诉我暂缓force matching的project,先开始基于hidden Markov Model (HMM)分析MD轨迹的课题。这个project来自前一年申请的国自基金项目,然而当时我尚未入组,这个课题迟迟未能完成。

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本文于2020年5月18日发表于知乎专栏,查看原文
本文于2020年5月19日发表于微信公众号,查看原文

上个月学校CSSA发了1000包,然而睡了一觉就完美错过了问卷。这次又发了500包,终于抢到了。

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