Jinzhe Zeng's Blog

苟利国家生死以,岂因祸福避趋之

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今天,笔者的第二篇第一作者论文“Complex reaction processes in combustion unraveled by neural network-based molecular dynamics simulation”在Nature Communications正式发表。华东师范大学为论文的第一单位。

在这篇论文中,笔者生成了甲烷燃烧的数据集,并使用DeePMD-kit软件构建了基于深度学习方法的反应势能面,进行了长达1 ns的甲烷燃烧反应的分子动力学模拟。借助笔者开发的ReacNetGenerator软件,笔者探明了甲烷燃烧的微观反应机理,对每个基元反应提供了原子尺度的理解。

在此,本文以个人视角,回顾这篇论文产生和发表的历程。

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今日,华东师范大学化学与分子工程学院(下文简称“学院”)在其官方网站发布《致用人单位的一封信》。文中指出,学院2020届毕业生就业工作表现优异,就业率和就业质量成绩显著;而2021届毕业生就业形势更为严峻,学院邀请各用人单位选聘毕业生。

笔者此前发现,学院2018届就业率仅85.66%,为2015届以来最低;但2019届就业率达98.78%,超过全校平均水平,其中本科生就业率达100%。今年9月,学院获学生就业工作先进集体称号。

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很多人对Anaconda有这样的误解,认为conda只是用来管理Python packages的。实际上,conda更神奇的功能,是可以打包编译后的程序,并且不需要root权限即可安装。一般来说,分发编译后的程序总有各种各样的静态库的依赖问题,所以Anaconda把这些依赖库也做成了conda packages,这样就能确保任何机器都能安装了。libtensorflow_cc是TensorFlow的C++库,之前介绍过如何编译,但编译成conda packages,仍需要费一番功夫。本文介绍2.3版本的构建方法:

我们先来看deepmd-kit-recipes/libtensorflow_cc-feedstockrecipe/build.sh文件。conda-build构建时,会默认把build.sh作为编译脚本。

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if [ ${cuda_compiler_version} == "None" ]; then
bash $RECIPE_DIR/build_cpu.sh
fi
if [ ${cuda_compiler_version} != "None" ]; then
bash $RECIPE_DIR/build_gpu.sh
fi
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作为一所公立大学,Rutgers University所有教职工的工资通过某种方式实现了公开。在这个页面可以查到去年所有人的工资。

我的课题组

我的课题组中,每个人的工资如下(只列举去年一整年都有工作的,下同):

Title人数2019年收入
Professor1$303,608
Associate Research Professor2$140,258和$140,843
Assistant Research Professor2$63,637和$69,517
Graduate Assistant1$33,189
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此前,本专栏介绍了conda install的使用方法,以及conda install安装deepmd-kit的方法。但是,目前对conda build构建conda packages的讨论甚少。授之以鱼不如授之以渔,这一系列将以deepmd-kit的packages为例,介绍conda包的构建方法。


本文先介绍python包的构建配方(recipe)。在deepmd-kit-feedstock这一项目中,recipe文件夹下包括conda_build_config.yamlmeta.yaml两个YAML文件,其中conda_build_config.yaml包含了构建变量,而meta.yaml包含了构建的元信息。

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8月12日下午,在学校要求下,去校医院做了核酸检测,全程自助+无接触。大概步骤是

步骤

刷校园卡领取试剂包。把唾沫吐到管子里,吐至刻度线。(要求没有气泡,但似乎没法避免。)把检测试剂当瓶盖拧上,这时蓝色试剂会自动流下去。摇匀。贴上名字,连同贴上条形码的申请表格一同放入袋中,扔进箱子里。

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