苟利国家生死以,岂因祸福避趋之

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DeePMD-kit: conda安装 & 离线安装

2019 年 10 月 24 日(UTC-4)微信公众号

近日,我已经通过 conda-build[1]构建了 deepmd-kit(含 lammps 模块)的 conda
packges[2],并用 constructor[3]打包了离线安装包。下介绍安装方法及注意事项:

一、conda 安装

安装 conda 后,使用以下命令安装 GPU 版:

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conda install deepmd-kit=*=*gpu lammps-dp=*=*gpu -c deepmodeling
将gpu改为cpu即可安装CPU版:
```bash
conda install deepmd-kit=*=*cpu lammps-dp=*=*cpu -c deepmodeling

如需指定版本,需将两个等号中间的*号改为版本号(目前有 1.0.1 和 0.12.8):

1
conda install deepmd-kit=1.0.1=*cpu lammps-dp=1.0.1=*cpu -c deepmodeling

二、离线安装

https://github.com/njzjz/deepmd-kit-recipes/releases 下载 v1.0.1 离线安装包(
也提供了百度网盘链接):

releases

下载后执行以下命令,按提示操作即可。

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sh deepmd-kit-1.0.1-*pu-Linux-x86_64.sh

三、使用与注意事项

dp 和 lmp 分别为 deepmd-kit 主程序与 lammps:

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2
dp -h
lmp -h

GPU 版本已经包含 CUDA 10.0,需要注意的是 CUDA 10.0 仅支持 NVIDIA 驱动 410.48 以
上,详情可参见 NVIDIA 官网 https://docs.nvidia.com/deploy/cuda-compatibility/

运行 dp 命令时,应设置环境变量 KMP_BLOCKTIME=0 和
KMP_AFFINITY=granularity=fine,verbose,compact,1,0,否则会导致高达 50%的性能损失
。这是由于 anaconda numpy 一个存在多年的 bug[4]


  1. 1.conda-build https://github.com/conda/conda-build
  2. 2.deepmd-kit-recipes https://github.com/njzjz/deepmd-kit-recipes
  3. 3.constructor https://github.com/conda/constructor
  4. 4.numpy/numpy#12374 https://github.com/numpy/numpy/issues/12374