Linux软件安装⑥|LAMMPS

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本文于2018年6月16日发表于知乎专栏,查看原文
本文于2018年6月17日发表于微信公众号,查看原文

本文将介绍 LAMMPS 在 Intel® MPI 、Open MPI 和 Ubuntu 下的安装方法。

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#下载解压
wget http://lammps.sandia.gov/tars/lammps-stable.tar.gz
tar -vxf lammps-stable.tar.gz
cd lammps-16Mar18/src
#安装Package，例如这里安装USER-REAXC
make yes-user-reaxc
#所有Package的列表可见http://lammps.sandia.gov/doc/Section_packages.html

Intel® MPI

根据官方资料（Intel® MPI Library），Intel® MPI比Open MPI快数倍。

配置好Intel® MPI的环境变量后，只需：

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make intel_cpu_intelmpi

即开始编译。

Open MPI

若已装Open MPI，可直接编译：

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make mpi

若机器上没有装任何MPI，可自行安装Open MPI：

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wget https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v3.1/openmpi-3.1.0.tar.bz2
tar -vxf openmpi-3.1.0.tar.bz2
cd openmpi-3.1.0/
./configure --prefix=$(pwd)
make all install

在$HOME/.bashrc中加入环境变量：

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export PATH=/home/njzjz/soft/openmpi-3.1.0/bin:$PATH
export LD_LIBRARY_PATH=/home/njzjz/soft/openmpi-3.1.0/lib:$LD_LIBRARY_PATH

然后在LAMMPS的src目录下编译：

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source $HOME/.bashrc
make mpi

Ubuntu

先用管理员权限安装一些软件，再编译：

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sudo apt install g++ mpi-default-bin mpi-default-dev libfftw3-dev libjpeg-dev libpng-dev
make ubuntu

最后

在当前目录下一键设置环境变量：

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echo 'export PATH=$PATH:'$(pwd)>>$HOME/.bashrc
source $HOME/.bashrc