苟利国家生死以,岂因祸福避趋之

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Linux软件安装①|Open Babel

2018年5月29日发布

#超算上都没有root权限,所以只能自己编译
wget https://jaist.dl.sourceforge.net/project/openbabel/openbabel/2.3.1/openbabel-2.3.1.tar.gz #下载
tar -vxzf openbabel-2.3.1.tar.gz #解压
mkdir openbabel openbabel-build #创建目录
installprefix=$(pwd)/openbabel #设置安装目录
cd ../openbabel-build #进入构建目录
cmake ../openbabel-2.3.1 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=$installprefix
make && make install #编译

#在.bashrc中设置环境变量
echo 'export PATH=$PATH:'$installprefix'/bin'>>$HOME/.bashrc
echo 'export BABEL_DATADIR='$installprefix'/share/openbabel/2.3.1'>>$HOME/.bashrc
source $HOME/.bashrc #应用环境变量

#可以尝试命令:obabel -:CC -opdb -O xx.pdb
#看看是否安装成功